Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC7Q96M83 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms