Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf72Q96LT7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms