Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms