Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms