Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms