Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUNDC1Q96C34 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms