Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC8Q96B26 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms