Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLUAP1Q96AJ1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms