Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms