Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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TRIM63Q969Q1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
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TRIM63Q969Q1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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TRIM63Q969Q1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM63Q969Q1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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