Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAVIN3Q969G5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms