Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMARCE1Q969G3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms