Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms