Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHMTQ93088 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms