Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DPF3Q92784 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DPF3Q92784 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DPF3Q92784 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DPF3Q92784 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DPF3Q92784 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DPF3Q92784 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DPF3Q92784 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DPF3Q92784 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms