Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM7

STAG1, Cohesin subunit SA-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG1Q8WVM7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG1Q8WVM7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG1Q8WVM7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms