Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX54Q8TDD1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX54Q8TDD1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms