Protein–RNA interactions for Protein: Q8N987

NECAB1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAB1Q8N987 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NECAB1Q8N987 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECAB1Q8N987 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECAB1Q8N987 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECAB1Q8N987 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NECAB1Q8N987 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECAB1Q8N987 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECAB1Q8N987 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECAB1Q8N987 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECAB1Q8N987 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECAB1Q8N987 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECAB1Q8N987 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECAB1Q8N987 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECAB1Q8N987 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECAB1Q8N987 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECAB1Q8N987 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECAB1Q8N987 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECAB1Q8N987 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECAB1Q8N987 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECAB1Q8N987 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECAB1Q8N987 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECAB1Q8N987 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECAB1Q8N987 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECAB1Q8N987 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECAB1Q8N987 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECAB1Q8N987 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECAB1Q8N987 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECAB1Q8N987 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECAB1Q8N987 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAB1Q8N987 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms