Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC82Q8N4S0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms