Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC2Q8N158 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC2Q8N158 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms