Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SYCP3Q8IZU3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms