Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF2Q8IX21 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLF2Q8IX21 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms