Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIBP1Q86W92 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIBP1Q86W92 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137 ms