Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APTXQ7Z2E3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms