Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP31Q70CQ4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
USP31Q70CQ4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
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