Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms