Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRCAPQ6ZRS2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRCAPQ6ZRS2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms