Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC141Q6ZP82 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms