Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
APOA5Q6Q788 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms