Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC42EP5Q6NZY7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP5Q6NZY7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms