Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H3F3CQ6NXT2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms