Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms