Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATL3Q6DD88 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL3Q6DD88 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms