Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GARNL3Q5VVW2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms