Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms