Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AGAP9Q5VTM2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AGAP9Q5VTM2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AGAP9Q5VTM2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AGAP9Q5VTM2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AGAP9Q5VTM2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AGAP9Q5VTM2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AGAP9Q5VTM2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AGAP9Q5VTM2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AGAP9Q5VTM2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AGAP9Q5VTM2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
AGAP9Q5VTM2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AGAP9Q5VTM2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AGAP9Q5VTM2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AGAP9Q5VTM2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
AGAP9Q5VTM2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AGAP9Q5VTM2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AGAP9Q5VTM2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AGAP9Q5VTM2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AGAP9Q5VTM2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms