Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PERM1Q5SV97 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms