Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KHDC3LQ587J8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms