Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TWISTNBQ3B726 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms