Protein–RNA interactions for Protein: Q30154

HLA-DRB5, HLA class II histocompatibility antigen, DR beta 5 chain, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRB5Q30154 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DRB5Q30154 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DRB5Q30154 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DRB5Q30154 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DRB5Q30154 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DRB5Q30154 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DRB5Q30154 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DRB5Q30154 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DRB5Q30154 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DRB5Q30154 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DRB5Q30154 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DRB5Q30154 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-DRB5Q30154 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DRB5Q30154 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DRB5Q30154 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DRB5Q30154 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DRB5Q30154 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DRB5Q30154 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DRB5Q30154 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DRB5Q30154 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DRB5Q30154 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DRB5Q30154 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DRB5Q30154 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DRB5Q30154 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DRB5Q30154 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-DRB5Q30154 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms