Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF4Q2M2E3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF4Q2M2E3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms