Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MICAQ29983 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MICAQ29983 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MICAQ29983 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MICAQ29983 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MICAQ29983 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MICAQ29983 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MICAQ29983 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MICAQ29983 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MICAQ29983 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MICAQ29983 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MICAQ29983 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MICAQ29983 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MICAQ29983 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MICAQ29983 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MICAQ29983 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MICAQ29983 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MICAQ29983 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MICAQ29983 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MICAQ29983 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MICAQ29983 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MICAQ29983 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MICAQ29983 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MICAQ29983 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MICAQ29983 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MICAQ29983 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MICAQ29983 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MICAQ29983 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MICAQ29983 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MICAQ29983 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MICAQ29983 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MICAQ29983 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MICAQ29983 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MICAQ29983 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MICAQ29983 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MICAQ29983 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MICAQ29983 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MICAQ29983 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MICAQ29983 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MICAQ29983 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MICAQ29983 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MICAQ29983 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MICAQ29983 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MICAQ29983 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MICAQ29983 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MICAQ29983 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MICAQ29983 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MICAQ29983 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MICAQ29983 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MICAQ29983 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MICAQ29983 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MICAQ29983 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MICAQ29983 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MICAQ29983 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MICAQ29983 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MICAQ29983 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MICAQ29983 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MICAQ29983 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MICAQ29983 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
MICAQ29983 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MICAQ29983 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MICAQ29983 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICAQ29983 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MICAQ29983 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms