Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKIDA1Q1XH10 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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