Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms