Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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