Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 C1orf132-204ENST00000637970 1170 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 AL513283.1-201ENST00000441790 1087 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FOXD1Q16676 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
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FOXD1Q16676 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 FGA-203ENST00000622532 1130 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
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