Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms