Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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RPE65Q16518 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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RPE65Q16518 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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RPE65Q16518 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPE65Q16518 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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RPE65Q16518 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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RPE65Q16518 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
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RPE65Q16518 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPE65Q16518 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
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