Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1EQ15878 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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