Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHRNA2Q15822 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms